L’équipe de Stein Aerts a apporté des contributions majeures à notre compréhension de la manière dont le code génomique est interprété et dont il régule les états physiologiques et pathologiques.

Parmi ses nombreuses découvertes fondamentales, Stein Aerts a joué un rôle clé dans le Fly Cell Atlas, qui a permis de définir la majorité des types cellulaires chez la drosophile. Son équipe a également mis en évidence des similarités inattendues entre les cerveaux des mammifères et des oiseaux, et réussi à générer des enhancers synthétiques complets permettant une expression spécifique à certains tissus.

Son laboratoire a aussi développé SCENIC, SCope et plusieurs autres outils que beaucoup d’entre vous ont probablement utilisés pour analyser des données d’omiques en cellule unique.