{"id":21552,"date":"2025-05-13T09:19:20","date_gmt":"2025-05-13T07:19:20","guid":{"rendered":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/?p=21552"},"modified":"2025-05-13T09:28:28","modified_gmt":"2025-05-13T07:28:28","slug":"transcriptomique-spatiale-de-la-drosophile-adulte","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/transcriptomique-spatiale-de-la-drosophile-adulte\/","title":{"rendered":"Transcriptomique spatiale de la drosophile adulte"},"content":{"rendered":"\t\t
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La transcriptomique spatiale documente les mod\u00e8les d’expression diff\u00e9rentielle de l’ARNm dans diff\u00e9rents types de muscles adultes. Notez la forte expression de la titine de la mouche (gros points jaunes) dans les noyaux proches des extr\u00e9mit\u00e9s des grands muscles de vol (en bleu\/rouge). <\/em><\/p>\n

Depuis plus de 100 ans, la drosophile<\/em> est un mod\u00e8le simple pour la g\u00e9n\u00e9tique, la biologie du d\u00e9veloppement et le comportement. Le g\u00e9nome de la drosophile<\/em> contient environ 13 000 g\u00e8nes exprim\u00e9s dans de nombreux types de cellules. Les chercheurs ont utilis\u00e9 des m\u00e9thodes de s\u00e9quen\u00e7age de l’ADN pour cataloguer l’expression des ARNm dans des milliers de cellules isol\u00e9es de la mouche adulte. Ce travail a abouti \u00e0 l’Atlas cellulaire de la mouche, qui d\u00e9finit plusieurs centaines de types cellulaires diff\u00e9rents, qui se distinguent par la combinaison de g\u00e8nes actifs. <\/p>\n

Beaucoup de ces types de cellules sont localis\u00e9s dans le cerveau de la mouche, mais la position exacte de plusieurs types de cellules \u00e9tait inconnue, parce que la m\u00e9thode de s\u00e9quen\u00e7age utilisait des cellules isol\u00e9es. Dans le cadre d’une collaboration entre le groupe Aerts de Louvain et le groupe Schnorrer de Marseille, nous avons maintenant d\u00e9termin\u00e9 l’emplacement d’un certain nombre de ces types de cellules inconnues dans le cerveau de la mouche et nous avons \u00e9galement \u00e9tudi\u00e9 l’expression des ARNm dans le corps de la mouche \u00e0 l’aide d’une nouvelle m\u00e9thode appel\u00e9e transcriptomique spatiale. Cette m\u00e9thode d\u00e9termine les positions o\u00f9 un g\u00e8ne est actif dans le corps de la mouche. Nous avons utilis\u00e9 des sections de la t\u00eate adulte pour mesurer l’expression dans le cerveau, et des sections du corps adulte pour d\u00e9terminer l’expression dans le corps entier pour un total de 150 g\u00e8nes diff\u00e9rents. <\/p>\n

La transcriptomique spatiale nous a permis de d\u00e9terminer la localisation de tous les principaux types de cellules de l’adulte. Elle a \u00e9galement permis d’identifier la localisation de types de cellules auparavant inconnus dans le cerveau de la mouche, dont l’existence n’avait \u00e9t\u00e9 d\u00e9finie qu’\u00e0 partir des donn\u00e9es de l’atlas des cellules de la mouche. De mani\u00e8re inattendue, nous avons d\u00e9couvert que dans les grandes cellules musculaires, qui contiennent des centaines de noyaux, certains ARNm sont pr\u00e9f\u00e9rentiellement produits par un petit sous-ensemble de noyaux. Cela sugg\u00e8re que tous les noyaux d’une cellule musculaire ne suivent pas le m\u00eame programme transcriptionnel \u00e0 un moment donn\u00e9. \u00c0 l’avenir, il sera int\u00e9ressant de d\u00e9couvrir le m\u00e9canisme qui permet d’y parvenir. <\/p>\n

En outre, les protocoles et les m\u00e9thodes informatiques pr\u00e9sent\u00e9s dans cette \u00e9tude montrent comment combiner les donn\u00e9es de l’atlas cellulaire avec la transcriptomique spatiale pour d\u00e9terminer la localisation des cellules identifi\u00e9es dans le corps d’un organisme.<\/p>\n

Janssens J, Mangeol P, Hecker N, Partel G, Spanier KI, Ismail JN, Hulselmans GJ, Aerts S, Schnorrer F. Spatial transcriptomics in the adult Drosophila<\/i> brain and body.<\/a> Elife. 2025 Mar 18;13:RP92618. <\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t

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\n\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\t\t\tRencontrez l'\u00e9quipe<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Cette \u00e9tude r\u00e9v\u00e8le les types de cellules c\u00e9r\u00e9brales et les sch\u00e9mas de localisation de l’ARNm dans les cellules musculaires de la drosophile adulte.<\/p>\n","protected":false},"author":27,"featured_media":21556,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[79,132],"tags":[],"class_list":["post-21552","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-news-fr","category-recherche","ibdm_team-team-127"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/21552","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/27"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=21552"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/21552\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":21563,"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/21552\/revisions\/21563"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/21556"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=21552"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=21552"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/staging.wp-ibdm.nicolasg.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=21552"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}